Na edição de2006 foi feita a ultima (e prevista) alteração no sistema de pontos corridos, reduzindo o número de equipes de 22 para 20, mantendo o número de rebaixados para a Série B em quatro equipes.
A equipe do São Paulo dominou a competição e conquistou o nacional pela quarta vez, com aproveitamento de 68%, vencendo 22 das 38 partidas disputadas. O Internacional, segundo colocado terminou a competição nove pontos atrás do São Paulo. As vagas na Libertadores de 2007 ficaram com São Paulo, Internacional, Grêmio, Santos e Paraná e os rebaixados foram Ponte Preta, Fortaleza, São Caetano e Santa Cruz.
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História