A fórmula de disputa do Campeonato de 90 foi um pouco confusa. Os times, divididos nos grupos A e B, faziam suas partidas do primeiro turno contra as equipes do outro grupo, enquanto no segundo turno jogavam contra as equipes da sua chave. Os vencedores dos grupos em cada turno avançavam para o quadrangular final.
As equipes classificadas para as quartas de final foram Atlético-MG e Santos (Grupo A) e Grêmio Palmeiras (Grupo B). A esses clubes, juntaram-se as quatro melhores campanhas gerais: Bahia, São Paulo, Bragantino e Corinthians. As duas ultimas equipes (São José-SP e Inter de Limeira-SP) da classificação geral acabaram rebaixadas.
O Corinthians acabou conquistando o título brasileiro de 90, vencendo o São Paulo por 1×0 nas duas partidas disputadas.